不透明（１００％）から最大透過（20％）まで10％単位に指定できます。
左図のようにメニューから項目を選択する以外にも、「＋」「－」キーを押し下げるショートカットもあります。
透過はScreenCutter全体に作用します。なお拡張枠のみ透過ができません。サンプル図は左上から順に、四角の透過（90%）、楕円の透過(80%)、角丸四角の透過(70%)、多角形の透過(60%)、特殊形の透過(50%)、背景に画像を付けた時の透過(40%)の例です。
背景部をクリックすると背景の色を変更することができます。
注：四角は本来背景部がありませんが、透過の場合のみ全体を背景として設定しました。